De acuerdo con el National Renewable Energy Laboratory (NREL), la biomasa tiene la capacidad de ser convertido directamente en un combustible líquido y esto es una característica única que lo separa de otras formas de energía renovable. Los biocombustibles son sustancias orgánicas o materiales de desecho que se pueden convertir a través del proceso de fermentación en un combustible usado para el transporte, tales como el etanol y el biodiesel. Algas microscópicas son otro tipo de biocombustible que puede ser utilizado dentro de la industria del transporte. Los microorganismos utilizan la energía del sol para combinar el dióxido de carbono y el agua con el fin de generar crecimiento de las plantas a un ritmo rápido. Los combustibles que se pueden crear a partir de microalgas incluyen biodiesel, diesel "verde" y el combustible de aviación, y se pueden mezclar con la gasolina para reducir las emisiones y aumentar el índice de octano para motores de automóviles convencionales. Biodiesel

De acuerdo con la Universidad de Washington, las algas se vio seriamente está considerando como un reemplazo de combustibles alternativos al petróleo durante la escasez de gasolina de 1970. Algunos de los factores principales que impiden la producción de combustible de algas a gran escala tiene que ver con los costos de producción y la tierra necesaria para producir este cultivo combustible. NREL estados que las microalgas tiene el potencial de competir con las fuentes convencionales de combustible ya que se puede cultivar en agua en lugar de la tierra y también se puede cultivar sin competir con los recursos alimentarios que son necesarios para proporcionar la nutrición para las personas. Actualmente, el biodiesel se mezcla con los productos derivados del petróleo los combustibles fósiles para reducir las emisiones y mejorar el suministro de combustible actuales.
Bio-hidrógeno

Existen diferentes métodos biológicos para la conversión de microalgas en un combustible a base de hidrógeno y que incluyen reformación con vapor de bio-aceites, fermentación oscuro y foto de materiales orgánicos y la fotólisis de agua catalizada por especies de microalgas especiales. Las microalgas puede producir combustible de hidrógeno a través de este proceso y de este combustible puede ser utilizado para las pilas de combustible, licuefacción de carbón y la mejora aceites pesados.
Bio-Oil

Bio-aceite se deriva en parte a partir de microalgas y se utiliza con la tecnología de hidrotratamiento con el fin de crear combustible para aviones o se utiliza para aplicaciones militares. Las microalgas se cultiva y se manipula con el fin de producir los lípidos o aceites y a continuación, se somete a un proceso de hidrotratamiento con el fin de crear combustible para aviones. Las microalgas se hidroprocesado dentro de una refinería de combustible y que se trata de la misma manera que el petróleo convencional.
Bio-Gas de síntesis

Cuando la biomasa se calienta con una cierta cantidad de oxígeno necesario para completar la combustión que produce una mezcla de monóxido de carbono e hidrógeno llamado gas de síntesis. La biomasa también se utiliza para producir un bio-aceite líquido cuando se calienta en ausencia de oxígeno. Una vez syngas y bio-oil se crean, que son procesados ​​en combustibles limpios que se pueden utilizar con la gasolina convencional.